DESCRIZIONE UNITA' OPERATIVA E COMPITI

L’UO Genomica raccoglie competenze e attività altamente specialistiche nel campo della tecnologia Next Generation Sequencing (NGS) e della bioinformatica. Gli ambiti di applicazione della NGS sono svariati e vanno dal sequenziamento del genoma di ceppi di patogeni batterici e virali per scopi epidemiologici, alla caratterizzazione di comunità complesse (eucariote e procariote), alla metagenomica per la diagnosi di laboratorio delle malattie infettive degli animali e delle zoonosi.

La strumentazione a disposizione dell’UO include strumenti per quantificazione e controllo qualità degli acidi nucleici (Qubit e Bioanalyzer), sistemi qPCR per la quantificazione delle librerie NGS (QuantStudio 5 e CFX96 -384), una piattaforma Illumina MiSeq.

Le competenze sono inoltre poste al servizio di diverse strutture dell’Istituto che intendano svolgere studi di biologia molecolare avanzata, i quali implichino un approccio di tipo genomico seguito da analisi bioinformatiche e filogenetiche/filogeografiche.

Sono attività dell'unità operativa:

• L’applicazione di tecniche di sequenziamento di ultima generazione per l’identificazione di patogeni e la caratterizzazione di comunità microbiche complesse.
• L’epidemiologia molecolare e la filogenesi/filogeografia dei patogeni.
• L’identificazione di specie del regno animale e di quello vegetale mediante un approccio untargeted
• La tracciabilità genomica per autenticazione degli alimenti e contro le frodi
• La caratterizzazione molecolare di tessuti neoplastici e del compartimento circolante (biopsia liquida), per l'indivduazione di alterazioni genomiche.
• La valutazione dell'espressione genica mediante targeted_RNA sequencing nei tumori primari.
• Il rilevamento di marker diagnostici e prognostici in tessuti neoplastici e sangue periferico.

SEDE U.O.

Via Bologna 148, Torino

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